(1) Vrcholným orgánem Akademie je valné shromáždění Akademie, které se skládá ze sboru členů Akademie a z Komory zástupců zvolených na pracovištích Akademie.
(2) Valné shromáždění
a) rozhoduje o zaměření činnosti a organizaci Akademie a určuje hlavní směry další práce a rozvoje Akademie,
b) projednává zprávu prezídia o činnosti Akademie,
c) na návrh prezídia stanoví, pro které vědní obory mají být zřízena vědecká kolegia.
(3) Prezídium Akademie svolává valné shromáždění nejméně jednou za rok.
(1) Stálým řídícím orgánem Akademie je prezídium Akademie, jež tvoří předseda Akademie, místopředsedové Akademie, vědecký sekretář Akademie a další členové prezídia. Počet místopředsedů Akademie a dalších členů prezídia určí vláda České a Slovenské Federativní Republiky na návrh valného shromáždění. Valné shromáždění navrhuje vládě složení prezídia na základě tajného hlasování z členů Akademie a ze zástupců zvolených na pracovištích Akademie. Členové prezídia za Slovenskou akademii věd jsou navrhováni na základě volby v Radě vědců Slovenské akademie věd. Místopředsedy Akademie, vědeckého sekretáře Akademie a další členy prezídia jmenuje na základě tohoto návrhu vláda České a Slovenské Federativní Republiky. Předsedu Akademie jmenuje prezident České a Slovenské Federativní Republiky na návrh vlády.
(2) Prezídium a jeho členové odpovídají za svou činnost valnému shromáždění a vládě České a Slovenské Federativní Republiky.
(3) Funkční období prezídia stanoví vláda České a Slovenské Federativní Republiky na návrh valného shromáždění.
(1) Presidium nebo předseda Akademie mohou pověřit jednotlivé členy presidia obstaráváním určitých činností; zejména pověřují místopředsedy Akademie péčí o koordinaci a komplexnost prací v jednotlivých oblastech vědeckého bádání. K zajišťování řídící a organizační činnosti může presidium Akademie na návrh předsedy Akademie též zřizovat komise a jiné pomocné orgány.
(2) Členové presidia Akademie pověření určitou činností podle odstavce 1 a předsedové (vedoucí) komisí a jiných pomocných orgánů jsou z výkonu této činnosti odpovědni presidiu Akademie a předsedovi Akademie, podávají jim o ní zprávy a předkládají jim podle potřeby své návrhy.
(1) Základními vědeckými orgány pro jednotlivé vědní obory jsou vědecká kolegia Akademie, složená z členů Akademie, ředitelů (vedoucích) a jiných pracovníků vědeckých pracovišť Akademie, pracovníků vysokých škol a dalších vědeckých, technických a hospodářských pracovníků, popřípadě i jiných vynikajících odborníků.
(2) Předsedu a ostatní členy vědeckého kolegia na návrh předsedy Akademie jmenuje a odvolává presidium Akademie, které řídí jejich činnost. Předseda kolegia odpovídá za výkon své funkce presidiu a předsedovi Akademie.
Orgány i funkcionáři Akademie a jejich pracovišť soustavně vytvářejí podmínky pro širokou účast pracovníků Akademie na řízení vědecké práce. Zásadní otázky, týkající se určitého vědeckého pracoviště, projednávají orgány Akademie zpravidla za účasti ředitele (vedoucího), popřípadě dalších pracovníků příslušného pracoviště.
Úkoly Akademie v oblasti správní, hospodářské a organizační zajišťuje aparát Akademie. Presidium Akademie určí způsob konkrétního řízení aparátu Akademie.
(1) Středisky vědeckovýzkumné činnosti Akademie jsou její vědecká pracoviště, jež rozvíjejí na nejvyšší úrovni vědeckovýzkumnou činnost v příslušném vědním oboru, těsně spolupracují s vysokými školami a ostatními vědeckovýzkumnými pracovišti, podílejí se na vědeckopopularizační a kulturní činnosti a přispívají k realizaci výsledků vědeckovýzkumných prací. Postup při zřizování a zrušování vědeckých pracovišť Akademie upravuje zvláštní zákon.
(2) V čele pracoviště je ředitel (vedoucí), jehož na návrh předsedy Akademie jmenuje a odvolává presidium Akademie. Ředitel (vedoucí) řídí veškerou činnost pracoviště a odpovídá za ni presidiu a předsedovi Akademie.
(3) Ředitel (vedoucí) vědeckého pracoviště je povinen vytvářet podmínky pro účast pracovníků na řízení vědecké práce pracoviště. Zaměření činnosti a organizaci pracoviště je ředitel povinen projednávat ve vědecké radě pracoviště.
(1) Povinností vědeckých pracovníků Akademie je tvůrčím způsobem usilovat o co nejúčinnější řešení teoreticky závažných a pro praxi důležitých vědeckých problémů, aktivně vědecky pracovat, neustále rozvíjet své teoretické znalosti i praktické zkušenosti, opírat se při své činnosti o kolektiv spolupracovníků; jsou též povinni účastnit se vědeckoorganizační práce na svém pracovišti.
(2) Povinností ředitele (vedoucího) vědeckého pracoviště Akademie je vytvářet podmínky pro to, aby každý vědecký pracovník mohl v rámci uložených úkolů na svém pracovišti plně rozvíjet své tvůrčí schopnosti a zvyšovat svou vědeckou kvalifikaci.
(3) Práva a povinnosti pracovníků vědeckých pracovišť Akademie upraví pracovní řády pracovišť.
Vnitřní poměry Akademie a právní postavení jejích orgánů a organizačních útvarů, způsob jednání a usnášení valného shromáždění podrobněji upraví stanovy Akademie, které schvaluje vláda České a Slovenské Federativní Republiky. Návrh stanov předkládá vládě předseda Akademie na základě rozhodnutí valného shromáždění.
Zrušuje se zákon č. 52/1952 Sb., o Československé akademii věd, ve znění zákona č. 53/1957 Sb., a vládní nařízení č. 91/1952 Sb., kterým se provádí zákon o Československé akademii věd.